国家水上应急救援南京油运队依托南京长江油运有限公司建设，驻地位于南京市，应急救援船舶日常停靠在南京市龙潭船舶基地。2012年，南京长江油运有限公司筹划申请建立“南京油运公司水上搜救队”，2015年12月建成运行，2018年1月国家安全生产应急救援指挥中心命名为国家水上应急救援南京油运队。主要服务长江南京港区，应急救援有效覆盖长江上至芜湖、下至江阴沿江300公里水域，承担水上船舶火灾、船只搁浅触礁、水上污油回收等水上交通和污染事故应急救援任务。 

　　水上救援南京队日常办事机构设在南京长江油运公司安全监管部，下设一个应急值班室、两个救援分队（水上清污应急救援分队、水上消拖应急救援分队）、三个应急小组（安全与战训组、装备与通信保障组、运维资金保障与考核组）。现有队员29人，其中专职作战队员20人（从事船舶驾驶和轮机的专业高级技术人员），兼职值班、管理人员9人。主要装备有全回转消拖两用船1艘、溢油回收船1艘，以及其他通信指挥装备。 

　　队伍成立以来，先后参加长江南京段水上应急救援行动16次，做到“行动迅速、救助专业”。2016年6月26日紧急驰援触礁的“国裕9号”轮，协助拖带脱礁；2018年8月8日，紧急驰援尾轴漏油的“涌鑫”轮，清除江面溢油，化解长江污染危机；2019年3月15日快速出动救助发生爆燃的化学品船“川维5”轮，协助扑灭火灾，并将其顶推至南岸冲滩。2016年获江苏省“搜救突出贡献奖”；2018年、2020年获江苏省“水上搜救先进集体”荣誉称号。